Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TPT1P10-201ENST00000312966 496 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AP000692.1-201ENST00000397184 596 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC025171.2-201ENST00000451894 1218 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms