Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms