Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARDQ03181 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms