Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX1P78337 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX1P78337 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX1P78337 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PITX1P78337 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX1P78337 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms