Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms