Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHBP55084 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHBP55084 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms