Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX5P50542 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX5P50542 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX5P50542 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX5P50542 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX5P50542 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX5P50542 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX5P50542 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX5P50542 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX5P50542 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms