Protein–RNA interactions for Protein: P49116

NR2C2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C2P49116 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C2P49116 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms