Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms