Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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