Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AFMP43652 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AFMP43652 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AFMP43652 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AFMP43652 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AFMP43652 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AFMP43652 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms