Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms