Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms