Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJC1P36383 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms