Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KDRP35968 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KDRP35968 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KDRP35968 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KDRP35968 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms