Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC27P30260 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC27P30260 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC27P30260 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC27P30260 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC27P30260 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC27P30260 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC27P30260 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC27P30260 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC27P30260 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC27P30260 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms