Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHP20396 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRHP20396 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRHP20396 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRHP20396 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRHP20396 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRHP20396 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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