Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD58P19256 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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