Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

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Length 1,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VCLP18206 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VCLP18206 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VCLP18206 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VCLP18206 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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