Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SFTPCP11686 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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