Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXB7P09629 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXB7P09629 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms