Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC9O60706 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms