Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms