Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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