Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMGB1P1B2RPK0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms