Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms