Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms