Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNPO3Q9Y5L0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms