Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TRAF6Q9Y4K3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TRAF6Q9Y4K3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TRAF6Q9Y4K3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TRAF6Q9Y4K3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TRAF6Q9Y4K3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRAF6Q9Y4K3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAF6Q9Y4K3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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