Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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