Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF346Q9UL40 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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