Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLKQ9UBT6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms