Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DKK3Q9UBP4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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DKK3Q9UBP4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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DKK3Q9UBP4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DKK3Q9UBP4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DKK3Q9UBP4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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