Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TFIP11Q9UBB9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFIP11Q9UBB9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms