Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms