Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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