Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms