Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNA4Q9HCM2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms