Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms