Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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