Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GORASP1Q9BQQ3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms