Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms