Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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