Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRSF12Q8WXF0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms