Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms