Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC33Q8N5R6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms