Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM48Q8IWZ4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms