Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms