Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms