Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A1Q6PCB7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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